Se describen, ilustran y comparan los aquenios de 37 especies de Valeriana de los Andes australes, a través de microscopía electrónica de barrido (MEB) y estereomicroscopía. Se muestra que el análisis detallado de los aquenios provee excelentes caracteres taxonómicos (forma del fruto, grado de desarrollo de los lóculos estériles y superficie del fruto) que permiten separar los taxones de Argentina y Chile austral. Los resultados son contrastados con la sistemática del género. Se definen cuatro grupos informales, y se presenta una clave para identificar las especies andinas de Valeriana basada en la morfología de los frutos. Palabras clave. Aquenio, sistemática, Sudamérica, Valeriana, Valerianaceae. Kutschker, A. 2008. Fruit morphology in Valeriana species (Valerianaceae) from the southern Andes. Darwiniana 46(1): 17-35. Achenes of the thirty seven Valeriana species from the southern Andes were described, illustrated and compared by scanning electron microscopy and stereomicroscopy. It is shown that the detailed analysis of the achenes provides excellent taxonomic characters (e.g. fruit shape, sterile locules development, fruit-coat surface) to distinguish among the southern Argentina and Chile taxa. Results are contrasted with the systematics of this genus. Four informal groups are established, and a key to the South-Andean species of Valeriana is provided, based on achene morphology. Keywords. Achene, South America, systematics, Valeriana, Valerianaceae.