El Área de Microbiología Ambiental, Agrícola y del Suelo abarca los trabajos de investigación sobre los procesos microbianos en el medio ambiente acuático y terrestre, las interacciones entre microorganismos y su evolución, con particular interés en el análisis de la estructura, las actividades y el comportamiento comunitario de las comunidades microbianas. El área comprende asimismo estudios sistemática de microbios en el entorno del suelo y la interrelación entre los microbios beneficiosos del suelo y las plantas de cultivo, su papel en la agricultura, el crecimiento, la salud del suelo y la productividad de plantas de interés agrícola.