·常规信息  最近更新:2023年6月20日 7:14:00
基因(座)名称绒毡层细胞持续存在; PHD锌指蛋白; 组蛋白结合蛋白; 温敏雄性核不育基因
PERSISTENT TAPETAL CELL1; PHD-Finger Protein; thermosensitive genic male sterility; histone binding protein; thermo-sensitive genic male sterility gene
基因符号OsMS1; PTC1; tms9-1
所在染色体9 (已克隆)

OsMS1(LOC_Os09g27620, Yang et al. 2019), PTC1(Li et al. 2011), 位于同一基因位点...

tms9-1是从细胞核雄性不育系“衡农S-1”中鉴定的温敏雄性核不育基因。

【定位与克隆】

tms9-1基因位于水稻9号染色体上两个dCAPS标记之间162kb的区段,与明恢63相比,衡农S-1 tms9-1候选基因Os09g27620存在一个T到C的置换,导致了一个氨基酸的变化(Qi et al. 2014)。

【突变体表型】

如右图,突变体osms1雄性完全不育,花药小而浅黄,花粉粒不可见。细胞学观察显示突变体花药中绒毡层细胞程序化死亡(PCD)过程延迟,花粉外壁缺失,利用TUNEL方法无法检测到DNA片段(Yang et al. 2019)。

ptc1除表现出类似拟南芥ms1的表型,如绒毡层降解延期、花粉壁异常和花粉败育,还表现出绒毡层细胞自由增殖和随后发生的坏死现象(Li et al. 2011)。

【时空表达谱】

PTC1特异的在水稻花药发育的第8、9阶段的绒毡层细胞和小孢子中表达,此时野生型绒毡层细胞正处于典型凋亡过程的起始阶段(Li et al. 2011)。

【亚细胞定位】

OsMS1:细胞核(Yang et al. 2019; Wu et al. 2022);OsMS1wenmin1:细胞核、细胞质(Wu et al. 2022)

【生物学功能】

OsMS1能与OsMADS15和TIP2发生互作,而TIP2协调TDR蛋白能够调控EAT1基因表达,进而调控绒毡层的PCD过程。表达分析结果显示,EAT1AP37AP25OsC6OsC4等与绒毡层PCD过程和花粉壁生物合成相关基因的表达量在突变体osms1中显著降低。说明OsMS1通过其PHD指与已知的绒毡层调控因子的相互作用,调节水稻绒毡层PCD和花粉外壁形成(Yang et al. 2019)。

OsMS1是个组蛋白结合蛋白。OsMS1wenmin1OsMS1天然等位基因,表现为温敏雄性不育。温度调节OsMS1和OsMS1wenmin1的丰度,OsMS1wenmin1比OsMS1对温度变化更敏感。高温大大降低了OsMS1wenmin1蛋白水平,使得细胞核中没有足够的OsMS1wenmin1与TDR互作,导致下游基因表达急剧下降并形成不育花粉(Wu et al. 2022)。

PTC1基因编码一个PHD锌指蛋白,它在调控绒毡层细胞程序化死亡及花粉发育的过程中起重要作用(Li et al. 2011)。

【相关登录号】
contigs及其产物:AP005308BAD37958; AP014965BAT08370
cDNAs及其产物:GU597363ADD91695, AK288120
参考基因组位点:Os09g0449000(RAP-DB, PhytoAB公司抗体服务←→ LOC_Os09g27620(本地MSU-RGAP, 百格基因突变体服务←→ LOC4347213(NCBI)
参考基因组产物:XM_015756036XP_015611522
uniprot库登录号:Q67V61
·ONTOLOGY及相关基因
表型特征花粉败育(TO:0000053), 温敏雄性核不育(TO:0000067), 花药颜色(TO:0000187), 花药长度(TO:0000531), 湿敏雄性核不育(TO:0001199)
分子功能转录激活因子活性(GO:0001216), 组蛋白结合(GO:0042393)
生物进程细胞程序性死亡(GO:0012501), 基因表达调控(GO:0010468), 绒毡层发育(GO:0048658), 花粉外壁形成(GO:0010584)
·参考文献
1Lunying Wu;Xiaohui Jing;Baolan Zhang;Shoujun Chen;Ran Xu;Penggen Duan;Danni Zou;Shengjian Huang;Tingbo Zhou;Chengcai An;Yuehua Luo;Yunhai Li
  A natural allele of OsMS1 responds to temperature changes and confers thermosensitive genic male sterility
  Nature Communications, 2022, 13: 2055
2Zhengfu Yang;Ling Liu;Lianping Sun;Ping Yu;Peipei Zhang;Adil Abbas;Xiaojiao Xiang;Weixun Wu;Yingxin Zhang;Liyong Cao;Shihua Cheng
  OsMS1 functions as a transcriptional activator to regulate programmed tapetum development and pollen exine formation in rice
  Plant Molecular Biology, 2019, 99(1-2): 175-191
3Yongbin Qi;Qinglong Liu;Lin Zhang;Bizeng Mao;Dawei Yan;Qingsheng Jin;Zuhua He
  Fine mapping and candidate gene analysis of the novel thermo-sensitive genic male sterility tms9-1 gene in rice
  Theoretical and Applied Genetics, 2014, 127(5): 1173-1182
4Hui Li;Zheng Yuan;Gema Vizcay-Barrena;Caiyun Yang;Wanqi Liang;Jie Zong;Zoe A. Wilson;Dabing Zhang
  PERSISTENT TAPETAL CELL1 Encodes a PHD-Finger Protein That Is Required for Tapetal Cell Death and Pollen Development in Rice
  Plant Physiology, 2011, 156(2): 615-630
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