索尔克科学家揭示了所有癌症中最常见的突变基因

索尔克科学家揭示了所有癌症中最常见的突变基因

研究结果表明，一些最受医学针对的突变并不像以前想象的那么常见

拉荷亚——在过去的十五年里，癌症研究人员一直在使用 DNA 测序技术来识别导致不同形式癌症的基因突变。 现在，索尔克助理教授 爱德华·斯蒂斯 他和他的计算科学家团队将基因突变信息与癌症患病率数据结合起来，揭示了美国整个癌症患者群体中癌症的遗传基础。

该研究发表在 自然通讯 13 年 2021 月 XNUMX 日，揭示了基因组中每个基因在癌症患者群体中突变的普遍程度。 这些发现可能有助于指导基因研究开发出比目前更有效的治疗方法。

“这篇论文回答了一个非常基本的问题：人类癌症中最常见的突变基因是什么？” 斯蒂茨说，他也是一名医生，也是赫斯特基金会发展主席的持有者。 “令人惊讶的是，这个问题还没有得到回答。”

基因突变在癌症的发生和生长中发挥着重要作用。 它们也可以成为有效治疗的目标。 然而，虽然许多研究已经确定了与某些癌症（如乳腺癌或淋巴瘤）有关的突变，但没有人能够以一种能够揭示哪些突变在整个癌症患者群体中最常见的方式组合数据。 每种癌症都是不同的，这使得确定哪些致癌基因和哪些药物靶点应优先进行进一步研究变得具有挑战性。

在这项新研究中，Stites 的团队结合了基因组和流行病学癌症研究的数据集，以确定所有癌症患者中存在基因突变的百分比。 尽管这项任务最初看起来很简单，但他们很快就发现了为什么这个问题以前没有得到解答：基因组和流行病学研究并未对各种癌症使用通用的命名系统。 例如，一些研究人员根据身体上的位置对癌症进行分类，而另一些研究人员则根据肿瘤类型对癌症进行分组，许多研究人员结合使用了两者。 这使得对齐数据集变得困难，而这对于确定不同突变的常见程度至关重要。

为了克服这一挑战，科学家们仔细分析了 200 多项研究，并根据一致的命名系统对每种癌症进行了单独审查和重新分类。 然后，他们比较了数据集，并考虑到某些癌症比其他癌症更常见的事实。 当他们分析数据时，他们发现一些普遍的信念是错误的。 例如，KRAS 是一种重要的促癌基因，据信它在 25% 的癌症中发生突变； 相反，人们发现它只与所有癌症的 11% 相关。 这是一种趋势的一部分，人们发现个体基因突变并不像以前想象的那么常见。

“这些发现表明有必要重新评估人们的时间、注意力和资源都集中在哪些地方，”斯蒂斯说。 “我们应该在不同的癌症遗传原因之间更均匀地平衡研究工作，并且我们应该在不同的主要治疗策略之间更均匀地平衡新的癌症治疗方法的开发，因为针对特定突变的概念的影响力将不如以前的那样。被假设了。”

这项研究的其他作者包括索尔克大学的 Gaurav Mendiratta、Meraj Aziz、David Liarakos 和 Melinda Tong 以及弗吉尼亚大学的 Eugene Ke。

该研究得到了先锋基金、美国国立卫生研究院和黑色素瘤研究联盟的支持。

作者： 10.1038 / s41467-021 - 26213-Y